1、基础研究。包括普洱茶内含的化学成分，大叶种茶叶的基因图谱、普洱茶活性成分的生物转化机理，普洱茶发酵过程中色、香、味的演化过程与机理，年份茶理化指标的鉴别方法与标准等等；

　　2、功能性研究。包括普洱茶解酒与护肝的功能与机理，普洱茶解油腻、刮肠通泄的原理，普洱茶抗辐射的机理，普洱茶提升人体免疫功能的机理等等；

　　3、药用成分及药用机理的研究。包括普洱茶降血糖的研究，普洱茶降血脂的研究，普洱茶降胆固醇的研究，普洱茶抗动脉硬化的研究，普洱茶抗癌的机理研究，普洱茶抗氧化机理的研究，普洱茶饮用安全性研究等等；

　　4、传统工艺水平的提升。包括普洱茶微生物发酵的机理及发酵模型，普洱茶发酵过程中生物酶及酶促发酵的机理，普洱茶发酵过程全自动流水线设备的研发，普洱茶压制设备的改进与提升，普洱茶无菌化生产流程环境要求与标准，普洱茶环保包装物的选用与标准等等；

　　5、陈化机理。包括普洱茶后发酵过程中品质变化的研究，普洱茶不同区域、不同方法陈化的动态模型研究等等；

　　6、深加工产品研发。包括纯茶饮料（不含香精、防腐剂、色素等添加剂），固态速溶茶（粉、膏），茶叶香水（不含香精、防腐剂、色素等添加剂），普洱茶内含化学成分单体的萃取与产业化（如茶红素、普洱茶皂素等），普洱茶酵素等等。

　　以上六个方面的科研课题，我们可以看出，“没有围墙的研究院”是遵循一种“大思路、大科研、跨学科、多领域、多层次、重参与”的科研思路与方法。2009年九月，由云南省主持的“普洱茶科学研究研讨会”上，发布的较大的科研课题二十多项，小的科研命题近一百项。而且近两年又新增了若干新的科研项目。